Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GDE1Q9NZC3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GDE1Q9NZC3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GDE1Q9NZC3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDE1Q9NZC3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDE1Q9NZC3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
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