Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LTBP3Q9NS15 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
LTBP3Q9NS15 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
LTBP3Q9NS15 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
LTBP3Q9NS15 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LTBP3Q9NS15 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LTBP3Q9NS15 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LTBP3Q9NS15 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LTBP3Q9NS15 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
LTBP3Q9NS15 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
LTBP3Q9NS15 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
LTBP3Q9NS15 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LTBP3Q9NS15 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LTBP3Q9NS15 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LTBP3Q9NS15 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
LTBP3Q9NS15 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
LTBP3Q9NS15 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LTBP3Q9NS15 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
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