Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS00

C1GALT1, Glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1GALT1Q9NS00 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1GALT1Q9NS00 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1GALT1Q9NS00 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1GALT1Q9NS00 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1GALT1Q9NS00 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1GALT1Q9NS00 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1GALT1Q9NS00 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1GALT1Q9NS00 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1GALT1Q9NS00 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1GALT1Q9NS00 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1GALT1Q9NS00 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1GALT1Q9NS00 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms