Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPHS2Q9NP85 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPHS2Q9NP85 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPHS2Q9NP85 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPHS2Q9NP85 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHS2Q9NP85 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms