Protein–RNA interactions for Protein: Q9H741

C12orf49, UPF0454 protein C12orf49, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf49Q9H741 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf49Q9H741 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf49Q9H741 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms