Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMEM39BQ9GZU3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMEM39BQ9GZU3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TMEM39BQ9GZU3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMEM39BQ9GZU3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TMEM39BQ9GZU3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMEM39BQ9GZU3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMEM39BQ9GZU3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TMEM39BQ9GZU3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMEM39BQ9GZU3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMEM39BQ9GZU3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMEM39BQ9GZU3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMEM39BQ9GZU3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMEM39BQ9GZU3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMEM39BQ9GZU3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMEM39BQ9GZU3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TMEM39BQ9GZU3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMEM39BQ9GZU3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMEM39BQ9GZU3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM39BQ9GZU3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM39BQ9GZU3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM39BQ9GZU3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM39BQ9GZU3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM39BQ9GZU3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM39BQ9GZU3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM39BQ9GZU3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMEM39BQ9GZU3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMEM39BQ9GZU3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMEM39BQ9GZU3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
TMEM39BQ9GZU3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMEM39BQ9GZU3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMEM39BQ9GZU3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms