Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SENP6Q9GZR1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP6Q9GZR1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP6Q9GZR1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP6Q9GZR1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP6Q9GZR1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SENP6Q9GZR1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP6Q9GZR1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP6Q9GZR1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP6Q9GZR1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP6Q9GZR1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP6Q9GZR1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP6Q9GZR1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP6Q9GZR1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP6Q9GZR1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SENP6Q9GZR1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SENP6Q9GZR1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SENP6Q9GZR1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1743.6 ms