Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZC3H12CQ9C0D7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZC3H12CQ9C0D7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZC3H12CQ9C0D7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ZC3H12CQ9C0D7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ZC3H12CQ9C0D7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZC3H12CQ9C0D7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZC3H12CQ9C0D7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZC3H12CQ9C0D7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms