Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSX2Q9BZM3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSX2Q9BZM3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GSX2Q9BZM3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSX2Q9BZM3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSX2Q9BZM3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms