Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BCO2Q9BYV7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BCO2Q9BYV7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCO2Q9BYV7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BCO2Q9BYV7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BCO2Q9BYV7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms