Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX74

TM2D1, TM2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1Q9BX74 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TM2D1Q9BX74 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM2D1Q9BX74 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TM2D1Q9BX74 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms