Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PAGR1Q9BTK6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAGR1Q9BTK6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAGR1Q9BTK6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAGR1Q9BTK6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246 ms