Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SIGMAR1Q99720 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SIGMAR1Q99720 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIGMAR1Q99720 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 904.3 ms