Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RGPD5Q99666 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RGPD5Q99666 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD5Q99666 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD5Q99666 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD5Q99666 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
RGPD5Q99666 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RGPD5Q99666 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD5Q99666 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD5Q99666 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD5Q99666 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RGPD5Q99666 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD5Q99666 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD5Q99666 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD5Q99666 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD5Q99666 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
RGPD5Q99666 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RGPD5Q99666 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms