Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELF4Q99607 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELF4Q99607 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ELF4Q99607 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ELF4Q99607 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms