Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CICQ96RK0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CICQ96RK0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CICQ96RK0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CICQ96RK0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CICQ96RK0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CICQ96RK0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms