Protein–RNA interactions for Protein: Q96I24

FUBP3, Far upstream element-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP3Q96I24 ZNF652-203ENST00000508237 4543 ntTSL 212.67□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 TAF1-218ENST00000485087 1738 ntTSL 512.2□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 NRIP1-206ENST00000637963 498 ntTSL 411.09□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 TAF1-211ENST00000468167 1767 ntTSL 510.8□□□□□ -0.684e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 DLC1-206ENST00000509922 455 ntTSL 410.79□□□□□ -0.684e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 DLC1-204ENST00000503161 562 ntTSL 410.67□□□□□ -0.74e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 TAF1-208ENST00000462588 1826 ntTSL 1 (best)10.26□□□□□ -0.774e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 TAF1-210ENST00000467309 1313 ntTSL 1 (best)10.06□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 IRX3-202ENST00000558054 444 ntTSL 210.05□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 CLASP1-212ENST00000480007 569 ntTSL 49.31□□□□□ -0.924e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 TAF1-205ENST00000437147 2295 ntTSL 1 (best)9.15□□□□□ -0.954e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 CLASP1-207ENST00000452274 3966 ntTSL 59.05□□□□□ -0.964e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 TAF1-202ENST00000373775 2199 ntTSL 59.05□□□□□ -0.964e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.984e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -14e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.044e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 ANKRA2-203ENST00000505301 512 ntTSL 28.47□□□□□ -1.054e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 CLASP1-206ENST00000449975 555 ntTSL 48.23□□□□□ -1.094e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.094e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 ZBTB18-202ENST00000622512 3740 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.114e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 CLASP1-211ENST00000474065 516 ntTSL 38.08□□□□□ -1.124e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 TAF1-215ENST00000482544 768 ntTSL 37.9□□□□□ -1.144e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.174e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.194e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.224e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 CLASP1-205ENST00000430234 582 ntTSL 47.37□□□□□ -1.234e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.244e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.314e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 CLASP1-204ENST00000418989 663 ntTSL 45.91□□□□□ -1.464e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 DLC1-205ENST00000506171 560 ntTSL 45.89□□□□□ -1.474e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 NECTIN3-207ENST00000485506 314 ntTSL 25.45□□□□□ -1.544e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.554e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.654e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.74e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.834e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 KDM7A-202ENST00000472616 7943 ntTSL 1 (best)5.83□□□□□ -1.486e-7■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 28.9
FUBP3Q96I24 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 28.8
FUBP3Q96I24 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.072e-8■■■■■ 28.8
FUBP3Q96I24 ARL1-201ENST00000261636 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.782e-8■■■■■ 28.8
FUBP3Q96I24 ARL1-203ENST00000539055 1231 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.982e-8■■■■■ 28.8
FUBP3Q96I24 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 28.8
FUBP3Q96I24 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 28.8
FUBP3Q96I24 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 28.8
FUBP3Q96I24 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 28.8
FUBP3Q96I24 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 28.7
FUBP3Q96I24 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.436e-7■■■■■ 28.7
FUBP3Q96I24 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 28.7
FUBP3Q96I24 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.334e-8■■■■■ 28.7
FUBP3Q96I24 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.474e-8■■■■■ 28.7
FUBP3Q96I24 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.996e-9■■■■■ 28.7
FUBP3Q96I24 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -16e-9■■■■■ 28.7
FUBP3Q96I24 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.166e-9■■■■■ 28.7
FUBP3Q96I24 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.166e-9■■■■■ 28.7
FUBP3Q96I24 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 28.6
FUBP3Q96I24 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 28.6
FUBP3Q96I24 AL359736.1-201ENST00000382141 4157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 28.6
FUBP3Q96I24 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 28.6
FUBP3Q96I24 SPATA13-206ENST00000424834 8603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 28.6
FUBP3Q96I24 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 28.6
FUBP3Q96I24 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 57.22□□□□□ -1.251e-9■■■■■ 28.6
FUBP3Q96I24 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.551e-8■■■■■ 28.6
FUBP3Q96I24 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.123e-8■■■■■ 28.5
FUBP3Q96I24 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.144e-6■■■■■ 28.5
FUBP3Q96I24 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.384e-6■■■■■ 28.5
FUBP3Q96I24 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.544e-6■■■■■ 28.5
FUBP3Q96I24 C3orf58-206ENST00000493396 536 ntTSL 316.79■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 28.4
FUBP3Q96I24 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 28.4
FUBP3Q96I24 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 28.4
FUBP3Q96I24 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.234e-18■■■■■ 28.4
FUBP3Q96I24 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.354e-18■■■■■ 28.4
FUBP3Q96I24 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.54e-18■■■■■ 28.4
FUBP3Q96I24 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.564e-18■■■■■ 28.4
FUBP3Q96I24 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.784e-18■■■■■ 28.4
FUBP3Q96I24 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 28.2
FUBP3Q96I24 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.386e-7■■■■■ 28.2
FUBP3Q96I24 SERPINE1-201ENST00000223095 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.733e-9■■■■■ 28.1
FUBP3Q96I24 TVP23C-CDRT4-204ENST00000557349 1005 ntTSL 217.85■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 28.1
FUBP3Q96I24 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 28.1
FUBP3Q96I24 CDRT4-203ENST00000524205 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 211□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 28.1
FUBP3Q96I24 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 28.1
FUBP3Q96I24 TVP23C-CDRT4-201ENST00000481756 556 ntTSL 46.59□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 28.1
FUBP3Q96I24 CDRT4-202ENST00000520956 470 ntTSL 43.17□□□□□ -1.92e-7■■■■■ 28.1
FUBP3Q96I24 TVP23C-CDRT4-202ENST00000518506 520 ntTSL 52.5□□□□□ -2.012e-7■■■■■ 28.1
FUBP3Q96I24 ASGR2-206ENST00000576487 1055 ntTSL 1 (best)16.93■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 28.1
FUBP3Q96I24 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 28.1
FUBP3Q96I24 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 28.1
FUBP3Q96I24 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 28.1
FUBP3Q96I24 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 28
FUBP3Q96I24 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 28
FUBP3Q96I24 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 28
FUBP3Q96I24 ZMYND8-215ENST00000468376 4064 ntTSL 1 (best)9.77□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 28
FUBP3Q96I24 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.38□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 28
FUBP3Q96I24 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 28
FUBP3Q96I24 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 28
FUBP3Q96I24 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 28
Retrieved 100 of 4,568 protein–RNA pairs in 136.6 ms