Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM143Q96AN5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM143Q96AN5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM143Q96AN5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM143Q96AN5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM143Q96AN5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM143Q96AN5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM143Q96AN5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM143Q96AN5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM143Q96AN5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMEM143Q96AN5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM143Q96AN5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM143Q96AN5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM143Q96AN5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM143Q96AN5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TMEM143Q96AN5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM143Q96AN5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM143Q96AN5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms