Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UFD1Q92890 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UFD1Q92890 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFD1Q92890 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms