Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEK9Q8TD19 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK9Q8TD19 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEK9Q8TD19 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEK9Q8TD19 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK9Q8TD19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms