Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID1BQ8NFD5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARID1BQ8NFD5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.56
ARID1BQ8NFD5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID1BQ8NFD5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms