Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CARMIL3Q8ND23 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL3Q8ND23 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL3Q8ND23 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CARMIL3Q8ND23 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARMIL3Q8ND23 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms