Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
LTBP4Q8N2S1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
LTBP4Q8N2S1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
LTBP4Q8N2S1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
LTBP4Q8N2S1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
LTBP4Q8N2S1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
LTBP4Q8N2S1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
LTBP4Q8N2S1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LTBP4Q8N2S1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LTBP4Q8N2S1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LTBP4Q8N2S1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
LTBP4Q8N2S1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
LTBP4Q8N2S1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LTBP4Q8N2S1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LTBP4Q8N2S1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
LTBP4Q8N2S1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
LTBP4Q8N2S1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LTBP4Q8N2S1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LTBP4Q8N2S1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LTBP4Q8N2S1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LTBP4Q8N2S1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LTBP4Q8N2S1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
LTBP4Q8N2S1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LTBP4Q8N2S1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LTBP4Q8N2S1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LTBP4Q8N2S1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LTBP4Q8N2S1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LTBP4Q8N2S1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LTBP4Q8N2S1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LTBP4Q8N2S1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms