Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPUSD2Q8IZ73 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPUSD2Q8IZ73 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RPUSD2Q8IZ73 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RPUSD2Q8IZ73 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPUSD2Q8IZ73 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPUSD2Q8IZ73 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPUSD2Q8IZ73 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPUSD2Q8IZ73 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPUSD2Q8IZ73 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RPUSD2Q8IZ73 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPUSD2Q8IZ73 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPUSD2Q8IZ73 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPUSD2Q8IZ73 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPUSD2Q8IZ73 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPUSD2Q8IZ73 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPUSD2Q8IZ73 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPUSD2Q8IZ73 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms