Protein–RNA interactions for Protein: Q7L804

RAB11FIP2, Rab11 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP2Q7L804 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11FIP2Q7L804 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP2Q7L804 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11FIP2Q7L804 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB11FIP2Q7L804 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms