Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP45Q70EL2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP45Q70EL2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP45Q70EL2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP45Q70EL2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms