Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNCKQ6P2M8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNCKQ6P2M8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNCKQ6P2M8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNCKQ6P2M8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 517.7 ms