Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
YOD1Q5VVQ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YOD1Q5VVQ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YOD1Q5VVQ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
YOD1Q5VVQ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms