Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC39.21■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
FRMPD1Q5SYB0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FRMPD1Q5SYB0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
FRMPD1Q5SYB0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
FRMPD1Q5SYB0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
FRMPD1Q5SYB0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
FRMPD1Q5SYB0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
FRMPD1Q5SYB0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
FRMPD1Q5SYB0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
FRMPD1Q5SYB0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
FRMPD1Q5SYB0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
FRMPD1Q5SYB0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
FRMPD1Q5SYB0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
FRMPD1Q5SYB0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
FRMPD1Q5SYB0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
FRMPD1Q5SYB0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
FRMPD1Q5SYB0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FRMPD1Q5SYB0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FRMPD1Q5SYB0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
FRMPD1Q5SYB0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
FRMPD1Q5SYB0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
FRMPD1Q5SYB0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
FRMPD1Q5SYB0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
FRMPD1Q5SYB0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
FRMPD1Q5SYB0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms