Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
SNAPC4Q5SXM2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC42.74■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC42.7■■■■■ 4.43
SNAPC4Q5SXM2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
SNAPC4Q5SXM2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SNAPC4Q5SXM2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SNAPC4Q5SXM2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SNAPC4Q5SXM2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
SNAPC4Q5SXM2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
SNAPC4Q5SXM2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
SNAPC4Q5SXM2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
SNAPC4Q5SXM2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
SNAPC4Q5SXM2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
SNAPC4Q5SXM2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
SNAPC4Q5SXM2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
SNAPC4Q5SXM2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
SNAPC4Q5SXM2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
SNAPC4Q5SXM2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
SNAPC4Q5SXM2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC42.61■■■■■ 4.41
SNAPC4Q5SXM2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
SNAPC4Q5SXM2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
SNAPC4Q5SXM2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
SNAPC4Q5SXM2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
SNAPC4Q5SXM2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
SNAPC4Q5SXM2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
SNAPC4Q5SXM2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
SNAPC4Q5SXM2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
SNAPC4Q5SXM2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
SNAPC4Q5SXM2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
SNAPC4Q5SXM2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SNAPC4Q5SXM2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SNAPC4Q5SXM2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SNAPC4Q5SXM2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
SNAPC4Q5SXM2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
SNAPC4Q5SXM2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
SNAPC4Q5SXM2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
SNAPC4Q5SXM2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC42.54■■■■■ 4.4
SNAPC4Q5SXM2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
SNAPC4Q5SXM2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
SNAPC4Q5SXM2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
SNAPC4Q5SXM2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
SNAPC4Q5SXM2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SNAPC4Q5SXM2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
SNAPC4Q5SXM2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SNAPC4Q5SXM2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms