Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
COL24A1Q17RW2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
COL24A1Q17RW2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
COL24A1Q17RW2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
COL24A1Q17RW2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
COL24A1Q17RW2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
COL24A1Q17RW2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms