Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMN1Q16637 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMN1Q16637 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMN1Q16637 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMN1Q16637 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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