Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2CQ14957 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GRIN2CQ14957 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.51■■■□□ 2
GRIN2CQ14957 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIN2CQ14957 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIN2CQ14957 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIN2CQ14957 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms