Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NEUROD1Q13562 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NEUROD1Q13562 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NEUROD1Q13562 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
NEUROD1Q13562 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NEUROD1Q13562 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NEUROD1Q13562 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
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