Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP140Q13342 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP140Q13342 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP140Q13342 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP140Q13342 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP140Q13342 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP140Q13342 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP140Q13342 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP140Q13342 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP140Q13342 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP140Q13342 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP140Q13342 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP140Q13342 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP140Q13342 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP140Q13342 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP140Q13342 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SP140Q13342 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP140Q13342 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP140Q13342 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP140Q13342 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP140Q13342 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SP140Q13342 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP140Q13342 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP140Q13342 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP140Q13342 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP140Q13342 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP140Q13342 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP140Q13342 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP140Q13342 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP140Q13342 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SP140Q13342 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SP140Q13342 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP140Q13342 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP140Q13342 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP140Q13342 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP140Q13342 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP140Q13342 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP140Q13342 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP140Q13342 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP140Q13342 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP140Q13342 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP140Q13342 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SP140Q13342 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP140Q13342 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP140Q13342 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP140Q13342 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP140Q13342 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP140Q13342 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP140Q13342 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP140Q13342 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP140Q13342 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SP140Q13342 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP140Q13342 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP140Q13342 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP140Q13342 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP140Q13342 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP140Q13342 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP140Q13342 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP140Q13342 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP140Q13342 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP140Q13342 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP140Q13342 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SP140Q13342 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP140Q13342 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP140Q13342 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP140Q13342 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP140Q13342 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SP140Q13342 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP140Q13342 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP140Q13342 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP140Q13342 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP140Q13342 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP140Q13342 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SP140Q13342 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SP140Q13342 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SP140Q13342 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP140Q13342 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP140Q13342 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140Q13342 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP140Q13342 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP140Q13342 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP140Q13342 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP140Q13342 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP140Q13342 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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