Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTA1Q13330 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTA1Q13330 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTA1Q13330 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTA1Q13330 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
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