Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBX3Q13185 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX3Q13185 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX3Q13185 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX3Q13185 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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