Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	LDB7	YBL006C	543 nt		11.7	□□□□□ -0.54
SMC4	Q12267	BIO3	YNR058W	1443 nt		11.7	□□□□□ -0.54
SMC4	Q12267	POR2	YIL114C	846 nt		11.69	□□□□□ -0.54
SMC4	Q12267	GAL83	YER027C	1254 nt		11.68	□□□□□ -0.54
SMC4	Q12267	STE3	YKL178C	1413 nt		11.66	□□□□□ -0.54
SMC4	Q12267	YNL295W	YNL295W	1575 nt		11.65	□□□□□ -0.54
SMC4	Q12267	PMP3	YDR276C	168 nt		11.65	□□□□□ -0.54
SMC4	Q12267	AAD14	YNL331C	1131 nt		11.65	□□□□□ -0.54
SMC4	Q12267	INP54	YOL065C	1155 nt		11.65	□□□□□ -0.54
SMC4	Q12267	PSD1	YNL169C	1503 nt		11.65	□□□□□ -0.54
SMC4	Q12267	MPH3	YJR160C	1809 nt		11.65	□□□□□ -0.55
SMC4	Q12267	RRP43	YCR035C	1185 nt		11.64	□□□□□ -0.55
SMC4	Q12267	CYS4	YGR155W	1524 nt		11.63	□□□□□ -0.55
SMC4	Q12267	DST1	YGL043W	930 nt		11.63	□□□□□ -0.55
SMC4	Q12267	TRP2	YER090W	1524 nt		11.62	□□□□□ -0.55
SMC4	Q12267	NDE2	YDL085W	1638 nt		11.62	□□□□□ -0.55
SMC4	Q12267	snR30	snR30	606 nt		11.61	□□□□□ -0.55
SMC4	Q12267	WSC3	YOL105C	1671 nt		11.61	□□□□□ -0.55
SMC4	Q12267	YGR137W	YGR137W	375 nt		11.6	□□□□□ -0.55
SMC4	Q12267	MTC6	YHR151C	1581 nt		11.6	□□□□□ -0.55
SMC4	Q12267	HAM1	YJR069C	594 nt		11.6	□□□□□ -0.55
SMC4	Q12267	CYT1	YOR065W	930 nt		11.6	□□□□□ -0.55
SMC4	Q12267	THI6	YPL214C	1623 nt		11.58	□□□□□ -0.56
SMC4	Q12267	SKP1	YDR328C	585 nt		11.58	□□□□□ -0.56
SMC4	Q12267	HIS3	YOR202W	663 nt		11.58	□□□□□ -0.56
SMC4	Q12267	PRY2	YKR013W	990 nt		11.57	□□□□□ -0.56
SMC4	Q12267	PPZ2	YDR436W	2133 nt		11.56	□□□□□ -0.56
SMC4	Q12267	MRP7	YNL005C	1116 nt		11.56	□□□□□ -0.56
SMC4	Q12267	DPM1	YPR183W	804 nt		11.56	□□□□□ -0.56
SMC4	Q12267	YLR184W	YLR184W	348 nt		11.54	□□□□□ -0.56
SMC4	Q12267	YML122C	YML122C	381 nt		11.54	□□□□□ -0.56
SMC4	Q12267	AVO2	YMR068W	1281 nt		11.54	□□□□□ -0.56
SMC4	Q12267	HRB1	YNL004W	1365 nt		11.54	□□□□□ -0.56
SMC4	Q12267	ERV25	YML012W	636 nt		11.52	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	ABP1	YCR088W	1779 nt		11.51	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	NFS1	YCL017C	1494 nt		11.51	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	CPR2	YHR057C	618 nt		11.51	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	AOS1	YPR180W	1044 nt		11.51	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	TDA4	YJR116W	840 nt		11.5	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	YPT10	YBR264C	600 nt		11.5	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	DML1	YMR211W	1428 nt		11.5	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	WSC4	YHL028W	1818 nt		11.49	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	YLR162W	YLR162W	357 nt		11.49	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	YPC1	YBR183W	951 nt		11.49	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	PIL1	YGR086C	1020 nt		11.48	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	AIM20	YIL158W	615 nt		11.48	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	DSC3	YOR223W	879 nt		11.48	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	TGL5	YOR081C	2250 nt		11.47	□□□□□ -0.57
SMC4	Q12267	NAF1	YNL124W	1479 nt		11.45	□□□□□ -0.58
SMC4	Q12267	ERG10	YPL028W	1197 nt		11.45	□□□□□ -0.58
SMC4	Q12267	OPI1	YHL020C	1215 nt		11.44	□□□□□ -0.58
SMC4	Q12267	ELP6	YMR312W	822 nt		11.44	□□□□□ -0.58
SMC4	Q12267	GET2	YER083C	858 nt		11.43	□□□□□ -0.58
SMC4	Q12267	TIF3	YPR163C	1311 nt		11.43	□□□□□ -0.58
SMC4	Q12267	HEL2	YDR266C	1920 nt		11.43	□□□□□ -0.58
SMC4	Q12267	INM1	YHR046C	888 nt		11.43	□□□□□ -0.58
SMC4	Q12267	GLY1	YEL046C	1164 nt		11.42	□□□□□ -0.58
SMC4	Q12267	SUN4	YNL066W	1263 nt		11.42	□□□□□ -0.58
SMC4	Q12267	SRM1	YGL097W	1449 nt		11.42	□□□□□ -0.58
SMC4	Q12267	MRPL35	YDR322W	1104 nt		11.41	□□□□□ -0.58
SMC4	Q12267	SML1	YML058W	315 nt		11.41	□□□□□ -0.58
SMC4	Q12267	MRN1	YPL184C	1839 nt		11.4	□□□□□ -0.58
SMC4	Q12267	DCR2	YLR361C	1737 nt		11.39	□□□□□ -0.59
SMC4	Q12267	YPR130C	YPR130C	408 nt		11.39	□□□□□ -0.59
SMC4	Q12267	HXT11	YOL156W	1704 nt		11.39	□□□□□ -0.59
SMC4	Q12267	FET5	YFL041W	1869 nt		11.38	□□□□□ -0.59
SMC4	Q12267	LEA1	YPL213W	717 nt		11.38	□□□□□ -0.59
SMC4	Q12267	YLR072W	YLR072W	2082 nt		11.38	□□□□□ -0.59
SMC4	Q12267	YPL136W	YPL136W	369 nt		11.37	□□□□□ -0.59
SMC4	Q12267	FIT1	YDR534C	1587 nt		11.36	□□□□□ -0.59
SMC4	Q12267	OPI7	YDR360W	435 nt		11.35	□□□□□ -0.59
SMC4	Q12267	YMR074C	YMR074C	438 nt		11.35	□□□□□ -0.59
SMC4	Q12267	GPD1	YDL022W	1176 nt		11.34	□□□□□ -0.59
SMC4	Q12267	YHR033W	YHR033W	1272 nt		11.34	□□□□□ -0.59
SMC4	Q12267	MDH1	YKL085W	1005 nt		11.34	□□□□□ -0.59
SMC4	Q12267	CIA1	YDR267C	993 nt		11.33	□□□□□ -0.6
SMC4	Q12267	LIA1	YJR070C	978 nt		11.33	□□□□□ -0.6
SMC4	Q12267	PAM17	YKR065C	594 nt		11.33	□□□□□ -0.6
SMC4	Q12267	YNL140C	YNL140C	570 nt		11.33	□□□□□ -0.6
SMC4	Q12267	FCY22	YER060W-A	1593 nt		11.31	□□□□□ -0.6
SMC4	Q12267	YDR510C-A	YDR510C-A	117 nt		11.3	□□□□□ -0.6
SMC4	Q12267	DAL80	YKR034W	810 nt		11.29	□□□□□ -0.6
SMC4	Q12267	CCW12	YLR110C	402 nt		11.28	□□□□□ -0.6
SMC4	Q12267	SCS22	YBL091C-A	528 nt		11.28	□□□□□ -0.6
SMC4	Q12267	YCL049C	YCL049C	939 nt		11.28	□□□□□ -0.6
SMC4	Q12267	SSC1	YJR045C	1965 nt		11.28	□□□□□ -0.6
SMC4	Q12267	CDA1	YLR307W	906 nt		11.27	□□□□□ -0.6
SMC4	Q12267	IMD1	YAR073W	1212 nt		11.26	□□□□□ -0.61
SMC4	Q12267	MRPL19	YNL185C	477 nt		11.26	□□□□□ -0.61
SMC4	Q12267	ERR3	YMR323W	1314 nt		11.26	□□□□□ -0.61
SMC4	Q12267	TUB1	YML085C	1344 nt		11.24	□□□□□ -0.61
SMC4	Q12267	NBA1	YOL070C	1506 nt		11.24	□□□□□ -0.61
SMC4	Q12267	KTR4	YBR199W	1395 nt		11.24	□□□□□ -0.61
SMC4	Q12267	VPS65	YLR322W	315 nt		11.23	□□□□□ -0.61
SMC4	Q12267	TPO1	YLL028W	1761 nt		11.23	□□□□□ -0.61
SMC4	Q12267	FTH1	YBR207W	1398 nt		11.23	□□□□□ -0.61
SMC4	Q12267	YJL163C	YJL163C	1668 nt		11.22	□□□□□ -0.61
SMC4	Q12267	YOL046C	YOL046C	675 nt		11.22	□□□□□ -0.61
SMC4	Q12267	YKL153W	YKL153W	510 nt		11.21	□□□□□ -0.61
SMC4	Q12267	YJL213W	YJL213W	996 nt		11.18	□□□□□ -0.62

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