Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 FIT1YDR534C 1587 nt7.59□□□□□ -1.19
UBX3Q12229 PMT7YDR307W 1989 nt7.59□□□□□ -1.19
UBX3Q12229 ERG6YML008C 1152 nt7.59□□□□□ -1.19
UBX3Q12229 MDH2YOL126C 1134 nt7.59□□□□□ -1.19
UBX3Q12229 SNU66YOR308C 1764 nt7.59□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 ELP4YPL101W 1371 nt7.58□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 DST1YGL043W 930 nt7.57□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 GRH1YDR517W 1119 nt7.56□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 TDH1YJL052W 999 nt7.56□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 CDA1YLR307W 906 nt7.56□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 PFS2YNL317W 1398 nt7.56□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 CPR2YHR057C 618 nt7.55□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 TAD2YJL035C 753 nt7.55□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 GDH1YOR375C 1365 nt7.55□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 MRP1YDR347W 966 nt7.53□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 APT1YML022W 564 nt7.53□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 MNN9YPL050C 1188 nt7.53□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 AOS1YPR180W 1044 nt7.53□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 AVL9YLR114C 2295 nt7.53□□□□□ -1.2
UBX3Q12229 YHR131CYHR131C 2553 nt7.52□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 PDC5YLR134W 1692 nt7.52□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.52□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 TES1YJR019C 1050 nt7.52□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 HSV2YGR223C 1347 nt7.52□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 HAM1YJR069C 594 nt7.51□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 PAU21YOR394W 495 nt7.51□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 PAU22YPL282C 495 nt7.51□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 CBK1YNL161W 2271 nt7.51□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 PEX28YHR150W 1740 nt7.51□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.5□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.5□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.5□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 CKB1YGL019W 837 nt7.5□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 NAS6YGR232W 687 nt7.5□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 ADE2YOR128C 1716 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 UFD1YGR048W 1086 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 ADE1YAR015W 921 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 SGF73YGL066W 1974 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 PSP2YML017W 1782 nt7.48□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.48□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 STE3YKL178C 1413 nt7.48□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 NUP53YMR153W 1428 nt7.48□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 ECM27YJR106W 2178 nt7.47□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 SLM3YDL033C 1254 nt7.47□□□□□ -1.21
UBX3Q12229 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 RSC9YML127W 1746 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 SPR1YOR190W 1338 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 RUP1YOR138C 2016 nt7.45□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 HAC1YFL031W 717 nt7.45□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 YHR033WYHR033W 1272 nt7.45□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 HRA1HRA1 564 nt7.45□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 SNA3YJL151C 402 nt7.45□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 MGM101YJR144W 810 nt7.45□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 VPS65YLR322W 315 nt7.45□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 YNL295WYNL295W 1575 nt7.45□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 RTG2YGL252C 1767 nt7.44□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 ERV25YML012W 636 nt7.44□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 PNS1YOR161C 1620 nt7.44□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 RRP43YCR035C 1185 nt7.43□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 CPT1YNL130C 1182 nt7.43□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 RCF2YNR018W 675 nt7.43□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 YOR343CYOR343C 327 nt7.43□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 MLS1YNL117W 1665 nt7.43□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 YDR215CYDR215C 414 nt7.42□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 YJL045WYJL045W 1905 nt7.42□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 TOM71YHR117W 1920 nt7.41□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 YJL043WYJL043W 774 nt7.4□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.4□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 MET8YBR213W 825 nt7.4□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 TOS1YBR162C 1368 nt7.4□□□□□ -1.22
UBX3Q12229 PAB1YER165W 1734 nt7.39□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 LEO1YOR123C 1395 nt7.39□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 DAL80YKR034W 810 nt7.39□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 PET10YKR046C 852 nt7.39□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 BUD20YLR074C 501 nt7.39□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 INP54YOL065C 1155 nt7.39□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 YPC1YBR183W 951 nt7.39□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 YBL113CYBL113C 2379 nt7.38□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 RRT6YGL146C 936 nt7.37□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 HXT9YJL219W 1704 nt7.37□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 YEL023CYEL023C 2049 nt7.37□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 FUS3YBL016W 1062 nt7.36□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 ERV2YPR037C 591 nt7.36□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 SNF7YLR025W 723 nt7.35□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 CAR2YLR438W 1275 nt7.35□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 CRN1YLR429W 1956 nt7.35□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 PSA1YDL055C 1086 nt7.34□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 CSM2YIL132C 642 nt7.34□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 NCA3YJL116C 1014 nt7.34□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 YPL264CYPL264C 1062 nt7.34□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 SPS1YDR523C 1473 nt7.34□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 BDS1YOL164W 1941 nt7.34□□□□□ -1.23
UBX3Q12229 MAM3YOL060C 2121 nt7.33□□□□□ -1.24
UBX3Q12229 HNM1YGL077C 1692 nt7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.8 ms