Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 SNP1YIL061C 903 nt9.44□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 MRP7YNL005C 1116 nt9.44□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 ALG7YBR243C 1347 nt9.44□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 GAL2YLR081W 1725 nt9.43□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 FAF1YIL019W 1041 nt9.43□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 COS10YNR075W 1125 nt9.43□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 HEL2YDR266C 1920 nt9.43□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 GTB1YDR221W 2109 nt9.42□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 INM1YHR046C 888 nt9.42□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 TOK1YJL093C 2076 nt9.42□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 ERV2YPR037C 591 nt9.41□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 CRN1YLR429W 1956 nt9.41□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 YIL177CYIL177C 5277 nt9.4□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 FTH1YBR207W 1398 nt9.4□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 PIH1YHR034C 1035 nt9.4□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 YNL140CYNL140C 570 nt9.4□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 TPO4YOR273C 1980 nt9.4□□□□□ -0.9
NSE3Q05541 TIF3YPR163C 1311 nt9.39□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 CPR2YHR057C 618 nt9.39□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 STS1YIR011C 960 nt9.39□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 SRM1YGL097W 1449 nt9.39□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 WSC4YHL028W 1818 nt9.38□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 TES1YJR019C 1050 nt9.38□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 CBK1YNL161W 2271 nt9.38□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 RRP43YCR035C 1185 nt9.37□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 DOC1YGL240W 753 nt9.37□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 YJR142WYJR142W 1029 nt9.37□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 ATP23YNR020C 813 nt9.37□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 MRN1YPL184C 1839 nt9.37□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 STE3YKL178C 1413 nt9.37□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 URH1YDR400W 1023 nt9.36□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 DST1YGL043W 930 nt9.36□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt9.36□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 YTH1YPR107C 627 nt9.36□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 SLM3YDL033C 1254 nt9.35□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 MAS2YHR024C 1449 nt9.35□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 FRA1YLL029W 2250 nt9.34□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 MLS1YNL117W 1665 nt9.34□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 YBL111CYBL111C 2004 nt9.34□□□□□ -0.91
NSE3Q05541 YNL295WYNL295W 1575 nt9.33□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 NMA2YGR010W 1188 nt9.33□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 YML034C-AYML034C-A 399 nt9.33□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 MSI1YBR195C 1269 nt9.33□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 MAE1YKL029C 2010 nt9.32□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 LAT1YNL071W 1449 nt9.32□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 PSA1YDL055C 1086 nt9.32□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 INP54YOL065C 1155 nt9.32□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 LCP5YER127W 1074 nt9.31□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 YGL081WYGL081W 963 nt9.31□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 MTC6YHR151C 1581 nt9.29□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 URA1YKL216W 945 nt9.29□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 OSM1YJR051W 1506 nt9.29□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 CKI1YLR133W 1749 nt9.28□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 KTR4YBR199W 1395 nt9.28□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 YOX1YML027W 1158 nt9.28□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 ARO7YPR060C 771 nt9.28□□□□□ -0.92
NSE3Q05541 HRB1YNL004W 1365 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 AOS1YPR180W 1044 nt9.27□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 CDC3YLR314C 1563 nt9.26□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 HAM1YJR069C 594 nt9.26□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 PTH2YBL057C 627 nt9.26□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 SPS1YDR523C 1473 nt9.26□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 PUS5YLR165C 765 nt9.25□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 ELP6YMR312W 822 nt9.25□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 UME1YPL139C 1383 nt9.24□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 YHL008CYHL008C 1884 nt9.24□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 ADH6YMR318C 1083 nt9.24□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 YPT10YBR264C 600 nt9.24□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 FHN1YGR131W 525 nt9.22□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 YHR033WYHR033W 1272 nt9.22□□□□□ -0.93
NSE3Q05541 PPZ2YDR436W 2133 nt9.21□□□□□ -0.94
NSE3Q05541 GET2YER083C 858 nt9.21□□□□□ -0.94
NSE3Q05541 PRY2YKR013W 990 nt9.21□□□□□ -0.94
NSE3Q05541 YPQ1YOL092W 927 nt9.21□□□□□ -0.94
NSE3Q05541 ORT1YOR130C 879 nt9.21□□□□□ -0.94
NSE3Q05541 AI5_BETAQ0075 1065 nt9.2□□□□□ -0.94
NSE3Q05541 CYS3YAL012W 1185 nt9.2□□□□□ -0.94
NSE3Q05541 CDA1YLR307W 906 nt9.2□□□□□ -0.94
NSE3Q05541 DSC3YOR223W 879 nt9.2□□□□□ -0.94
NSE3Q05541 YPL067CYPL067C 597 nt9.2□□□□□ -0.94
NSE3Q05541 ATG22YCL038C 1587 nt9.2□□□□□ -0.94
NSE3Q05541 MGM101YJR144W 810 nt9.19□□□□□ -0.94
NSE3Q05541 TRR2YHR106W 1029 nt9.18□□□□□ -0.94
NSE3Q05541 KDX1YKL161C 1302 nt9.18□□□□□ -0.94
NSE3Q05541 MIM1YOL026C 342 nt9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.5 ms