Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSTF1Q05048 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSTF1Q05048 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSTF1Q05048 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSTF1Q05048 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CSTF1Q05048 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms