Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCN7AQ01118 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SCN7AQ01118 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SCN7AQ01118 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SCN7AQ01118 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCN7AQ01118 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCN7AQ01118 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms