Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BEX3Q00994 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BEX3Q00994 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BEX3Q00994 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BEX3Q00994 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BEX3Q00994 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BEX3Q00994 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BEX3Q00994 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BEX3Q00994 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BEX3Q00994 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BEX3Q00994 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms