Protein–RNA interactions for Protein: Q00723

PRP38, Pre-mRNA-splicing factor 38, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP38Q00723 BXI1YNL305C 894 nt7.51□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 SNU66YOR308C 1764 nt7.51□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 YPR084WYPR084W 1371 nt7.5□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 MRP1YDR347W 966 nt7.5□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 YER156CYER156C 1017 nt7.5□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 RPS6AYPL090C 711 nt7.5□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 RPS6BYBR181C 711 nt7.5□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 TES1YJR019C 1050 nt7.49□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 CDA1YLR307W 906 nt7.49□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 ALR1YOL130W 2580 nt7.49□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 JHD1YER051W 1479 nt7.49□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 PMT1YDL095W 2454 nt7.49□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 TPO1YLL028W 1761 nt7.48□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 AVL9YLR114C 2295 nt7.48□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 RPL12BYDR418W 498 nt7.48□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 GCD11YER025W 1584 nt7.48□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 CKB1YGL019W 837 nt7.48□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 YMR206WYMR206W 942 nt7.48□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 RSC9YML127W 1746 nt7.47□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 ADE2YOR128C 1716 nt7.47□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 YPL264CYPL264C 1062 nt7.47□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 SGF73YGL066W 1974 nt7.47□□□□□ -1.21
PRP38Q00723 PMU1YKL128C 888 nt7.46□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 MNN9YPL050C 1188 nt7.46□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 ARG7YMR062C 1326 nt7.46□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 GDH1YOR375C 1365 nt7.46□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 RRT6YGL146C 936 nt7.45□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.45□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 ADA2YDR448W 1305 nt7.45□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 HAM1YJR069C 594 nt7.44□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 AOS1YPR180W 1044 nt7.44□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 YDR306CYDR306C 1437 nt7.44□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 DST1YGL043W 930 nt7.43□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 TAD2YJL035C 753 nt7.43□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 PEX28YHR150W 1740 nt7.42□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 LPD1YFL018C 1500 nt7.42□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 PDC5YLR134W 1692 nt7.41□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 ATP2YJR121W 1536 nt7.41□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 HXT9YJL219W 1704 nt7.41□□□□□ -1.22
PRP38Q00723 UTR5YEL035C 501 nt7.39□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 AIM34YMR003W 597 nt7.39□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 LEO1YOR123C 1395 nt7.38□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 ELP4YPL101W 1371 nt7.38□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 YER152CYER152C 1332 nt7.38□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 TDH1YJL052W 999 nt7.38□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 RCF2YNR018W 675 nt7.38□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 MAM3YOL060C 2121 nt7.38□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 RUP1YOR138C 2016 nt7.37□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 PRC1YMR297W 1599 nt7.37□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 YHR033WYHR033W 1272 nt7.36□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 YIL168WYIL168W 384 nt7.36□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 SPE4YLR146C 903 nt7.36□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 CPR2YHR057C 618 nt7.35□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 SNA3YJL151C 402 nt7.35□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 BEM1YBR200W 1656 nt7.35□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.34□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.34□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.34□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.34□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.34□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.34□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.34□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 PET10YKR046C 852 nt7.34□□□□□ -1.23
PRP38Q00723 ITR1YDR497C 1755 nt7.33□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 EDC2YER035W 438 nt7.33□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 YLR030WYLR030W 792 nt7.33□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 CHA1YCL064C 1083 nt7.32□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 VPS65YLR322W 315 nt7.32□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 ERV25YML012W 636 nt7.32□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 APT1YML022W 564 nt7.32□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 ECM10YEL030W 1935 nt7.32□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 MET30YIL046W 1923 nt7.32□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 ADE1YAR015W 921 nt7.31□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 NUP53YMR153W 1428 nt7.31□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 YNL190WYNL190W 615 nt7.31□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 YOR268CYOR268C 399 nt7.31□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 YBL113CYBL113C 2379 nt7.3□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 YPC1YBR183W 951 nt7.3□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.29□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 STE3YKL178C 1413 nt7.28□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.28□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 YDR215CYDR215C 414 nt7.28□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 GNA1YFL017C 480 nt7.28□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 SNF7YLR025W 723 nt7.28□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 CAR2YLR438W 1275 nt7.28□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 FUS3YBL016W 1062 nt7.28□□□□□ -1.24
PRP38Q00723 MAL31YBR298C 1845 nt7.27□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 YEL023CYEL023C 2049 nt7.27□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 YDR476CYDR476C 675 nt7.27□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 YJL043WYJL043W 774 nt7.27□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 TOS1YBR162C 1368 nt7.27□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 DCR2YLR361C 1737 nt7.27□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 DAL80YKR034W 810 nt7.26□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 YOR041CYOR041C 432 nt7.26□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 LAS17YOR181W 1902 nt7.26□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 HNM1YGL077C 1692 nt7.25□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 YNL295WYNL295W 1575 nt7.25□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 TPI1YDR050C 747 nt7.25□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 ATP10YLR393W 840 nt7.25□□□□□ -1.25
PRP38Q00723 PUS7YOR243C 2031 nt7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 195.3 ms