Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CLTCQ00610 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CLTCQ00610 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CLTCQ00610 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CLTCQ00610 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CLTCQ00610 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CLTCQ00610 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CLTCQ00610 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CLTCQ00610 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CLTCQ00610 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CLTCQ00610 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CLTCQ00610 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CLTCQ00610 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CLTCQ00610 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CLTCQ00610 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CLTCQ00610 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
CLTCQ00610 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CLTCQ00610 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CLTCQ00610 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
CLTCQ00610 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CLTCQ00610 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CLTCQ00610 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CLTCQ00610 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CLTCQ00610 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CLTCQ00610 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CLTCQ00610 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
CLTCQ00610 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CLTCQ00610 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CLTCQ00610 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CLTCQ00610 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CLTCQ00610 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CLTCQ00610 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CLTCQ00610 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CLTCQ00610 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CLTCQ00610 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CLTCQ00610 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CLTCQ00610 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CLTCQ00610 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CLTCQ00610 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CLTCQ00610 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CLTCQ00610 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms