Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PIP4K2BP78356 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PIP4K2BP78356 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PIP4K2BP78356 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
PIP4K2BP78356 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
PIP4K2BP78356 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PIP4K2BP78356 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PIP4K2BP78356 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PIP4K2BP78356 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
PIP4K2BP78356 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PIP4K2BP78356 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PIP4K2BP78356 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PIP4K2BP78356 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PIP4K2BP78356 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PIP4K2BP78356 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PIP4K2BP78356 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PIP4K2BP78356 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PIP4K2BP78356 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
PIP4K2BP78356 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PIP4K2BP78356 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PIP4K2BP78356 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PIP4K2BP78356 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PIP4K2BP78356 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PIP4K2BP78356 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PIP4K2BP78356 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PIP4K2BP78356 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PIP4K2BP78356 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PIP4K2BP78356 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PIP4K2BP78356 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PIP4K2BP78356 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PIP4K2BP78356 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PIP4K2BP78356 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PIP4K2BP78356 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms