Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM258P61165 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM258P61165 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM258P61165 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms