Protein–RNA interactions for Protein: P56181

NDUFV3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV3P56181 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NDUFV3P56181 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDUFV3P56181 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFV3P56181 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NDUFV3P56181 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms