Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh3bp1P55194 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bp1P55194 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp1P55194 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bp1P55194 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3bp1P55194 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3bp1P55194 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms