Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 YGR137WYGR137W 375 nt7.1□□□□□ -1.27
SYF2P53277 DST1YGL043W 930 nt7.09□□□□□ -1.27
SYF2P53277 CDA1YLR307W 906 nt7.09□□□□□ -1.27
SYF2P53277 YPL264CYPL264C 1062 nt7.09□□□□□ -1.27
SYF2P53277 ITR1YDR497C 1755 nt7.09□□□□□ -1.27
SYF2P53277 PEX28YHR150W 1740 nt7.09□□□□□ -1.27
SYF2P53277 PRC1YMR297W 1599 nt7.08□□□□□ -1.28
SYF2P53277 AVL9YLR114C 2295 nt7.08□□□□□ -1.28
SYF2P53277 ARG7YMR062C 1326 nt7.07□□□□□ -1.28
SYF2P53277 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.07□□□□□ -1.28
SYF2P53277 PMU1YKL128C 888 nt7.07□□□□□ -1.28
SYF2P53277 ATP10YLR393W 840 nt7.07□□□□□ -1.28
SYF2P53277 ADA2YDR448W 1305 nt7.06□□□□□ -1.28
SYF2P53277 SNA3YJL151C 402 nt7.06□□□□□ -1.28
SYF2P53277 SPE4YLR146C 903 nt7.06□□□□□ -1.28
SYF2P53277 RUP1YOR138C 2016 nt7.05□□□□□ -1.28
SYF2P53277 CKB1YGL019W 837 nt7.05□□□□□ -1.28
SYF2P53277 YPR084WYPR084W 1371 nt7.05□□□□□ -1.28
SYF2P53277 YIL168WYIL168W 384 nt7.04□□□□□ -1.28
SYF2P53277 VPS65YLR322W 315 nt7.04□□□□□ -1.28
SYF2P53277 ERG6YML008C 1152 nt7.04□□□□□ -1.28
SYF2P53277 MFT1YML062C 1179 nt7.04□□□□□ -1.28
SYF2P53277 AOS1YPR180W 1044 nt7.04□□□□□ -1.28
SYF2P53277 BEM1YBR200W 1656 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF2P53277 CPR2YHR057C 618 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF2P53277 TES1YJR019C 1050 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF2P53277 HAM1YJR069C 594 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF2P53277 YMR206WYMR206W 942 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF2P53277 TOP3YLR234W 1971 nt7.02□□□□□ -1.29
SYF2P53277 YDR306CYDR306C 1437 nt7.02□□□□□ -1.29
SYF2P53277 APT1YML022W 564 nt7.02□□□□□ -1.29
SYF2P53277 NSG2YNL156C 900 nt7.02□□□□□ -1.29
SYF2P53277 ELP4YPL101W 1371 nt7.01□□□□□ -1.29
SYF2P53277 GGC1YDL198C 903 nt7.01□□□□□ -1.29
SYF2P53277 RCR1YBR005W 642 nt7.01□□□□□ -1.29
SYF2P53277 RSC9YML127W 1746 nt7.01□□□□□ -1.29
SYF2P53277 ERV25YML012W 636 nt7□□□□□ -1.29
SYF2P53277 HXT9YJL219W 1704 nt6.99□□□□□ -1.29
SYF2P53277 ERR3YMR323W 1314 nt6.99□□□□□ -1.29
SYF2P53277 ERR1YOR393W 1314 nt6.99□□□□□ -1.29
SYF2P53277 ERR2YPL281C 1314 nt6.99□□□□□ -1.29
SYF2P53277 YBL113CYBL113C 2379 nt6.98□□□□□ -1.29
SYF2P53277 YDR215CYDR215C 414 nt6.98□□□□□ -1.29
SYF2P53277 YIA6YIL006W 1122 nt6.98□□□□□ -1.29
SYF2P53277 FRT1YOR324C 1809 nt6.98□□□□□ -1.29
SYF2P53277 YER152CYER152C 1332 nt6.98□□□□□ -1.29
SYF2P53277 RRT6YGL146C 936 nt6.97□□□□□ -1.29
SYF2P53277 TDH1YJL052W 999 nt6.97□□□□□ -1.29
SYF2P53277 STE3YKL178C 1413 nt6.97□□□□□ -1.29
SYF2P53277 YMR253CYMR253C 1245 nt6.97□□□□□ -1.29
SYF2P53277 RCF2YNR018W 675 nt6.97□□□□□ -1.29
SYF2P53277 PUS7YOR243C 2031 nt6.97□□□□□ -1.29
SYF2P53277 MNN9YPL050C 1188 nt6.97□□□□□ -1.29
SYF2P53277 YLR173WYLR173W 1827 nt6.95□□□□□ -1.3
SYF2P53277 YHR033WYHR033W 1272 nt6.95□□□□□ -1.3
SYF2P53277 TAD2YJL035C 753 nt6.95□□□□□ -1.3
SYF2P53277 YNL295WYNL295W 1575 nt6.95□□□□□ -1.3
SYF2P53277 LEO1YOR123C 1395 nt6.95□□□□□ -1.3
SYF2P53277 CTF3YLR381W 2202 nt6.93□□□□□ -1.3
SYF2P53277 HNM1YGL077C 1692 nt6.93□□□□□ -1.3
SYF2P53277 GRH1YDR517W 1119 nt6.92□□□□□ -1.3
SYF2P53277 YLR030WYLR030W 792 nt6.92□□□□□ -1.3
SYF2P53277 TCB1YOR086C 3561 nt6.92□□□□□ -1.3
SYF2P53277 GDH1YOR375C 1365 nt6.92□□□□□ -1.3
SYF2P53277 CKI1YLR133W 1749 nt6.91□□□□□ -1.3
SYF2P53277 PSP2YML017W 1782 nt6.91□□□□□ -1.3
SYF2P53277 PET10YKR046C 852 nt6.91□□□□□ -1.3
SYF2P53277 ADE1YAR015W 921 nt6.91□□□□□ -1.3
SYF2P53277 RRP43YCR035C 1185 nt6.9□□□□□ -1.3
SYF2P53277 MRP1YDR347W 966 nt6.9□□□□□ -1.3
SYF2P53277 HAC1YFL031W 717 nt6.9□□□□□ -1.3
SYF2P53277 DAL80YKR034W 810 nt6.9□□□□□ -1.3
SYF2P53277 RIB1YBL033C 1038 nt6.9□□□□□ -1.3
SYF2P53277 YPC1YBR183W 951 nt6.9□□□□□ -1.3
SYF2P53277 SPR1YOR190W 1338 nt6.9□□□□□ -1.3
SYF2P53277 NUP53YMR153W 1428 nt6.9□□□□□ -1.31
SYF2P53277 PMA2YPL036W 2844 nt6.9□□□□□ -1.31
SYF2P53277 SOD2YHR008C 702 nt6.89□□□□□ -1.31
SYF2P53277 PNS1YOR161C 1620 nt6.89□□□□□ -1.31
SYF2P53277 AQR1YNL065W 1761 nt6.89□□□□□ -1.31
SYF2P53277 RTG2YGL252C 1767 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF2P53277 POB3YML069W 1659 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF2P53277 YJL043WYJL043W 774 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF2P53277 CAR2YLR438W 1275 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF2P53277 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF2P53277 PAU21YOR394W 495 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF2P53277 PAU22YPL282C 495 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF2P53277 BDS1YOL164W 1941 nt6.88□□□□□ -1.31
SYF2P53277 YKR018CYKR018C 2178 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF2P53277 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF2P53277 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF2P53277 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF2P53277 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF2P53277 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF2P53277 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF2P53277 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF2P53277 SNF7YLR025W 723 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF2P53277 CPT1YNL130C 1182 nt6.87□□□□□ -1.31
SYF2P53277 SPS1YDR523C 1473 nt6.86□□□□□ -1.31
SYF2P53277 INP54YOL065C 1155 nt6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 102.9 ms